頭皮のかゆみや低血圧
ミノキシジルの一般的な副作用としては、まず頭皮の痒みがあげられます。
シャンプー・歯磨き・化粧品・洗剤・育毛剤などの製品の凝固を防ぐ基剤成分であるPG（プロピレングリコール）に対するアレルギー反応が原因です。また、高配合のミノキシジルを湿布すると、薬剤使用部分にニキビが発生する事があります。湿布部分の皮膚下で成分が拡散し、湿布意外の毛細血管まで活発にしてしまう事から赤ら顔などの症状が出る事もあります。
もともとミノキシジルは降圧剤として開発されたものです。ミノキシジルを服用して多毛症になる患者が多かった事で、新たに育毛剤として研究されてきました。もともとは降圧剤なので、血圧が極端に低い人は使用を控えるなど注意が必要です。
その他の副作用
個人差はありますが、一部で下記のような副作用が報告されています。湿布タイプか口径薬タイプかでも副作用の強さは変わってきます。
・使用初期に脱毛が増える→新しい毛を誕生させる準備のため、一時脱毛症状が増えるため
・服用中止による抜け毛→服用を中止すると、抜け毛の症状が元に戻ってしまう。これは、使用を止めてしまうと、その間に生えてきた毛は抜け落ちる可能性があるからです。
・精力減退や勃起障害→男性にとっては一大事ですが、本当に稀なようです
・体毛などの増加→顔の産毛やどうでもいいところの体毛までが太く長くなる。こちらは反対に女性にとっては大問題です
その他、むくみ（特に朝）・胸の痛み・動悸など心臓や血管に関係した副作用も報告されています。
自己判断で強行したり止めたりしない
ミノキシジルだけではありませんが、こちらは医薬品となり、医師の指導のもと使用するようにします。
身体に合わない方法でむやみに続けたりすると、副作用を悪化させるだけではなく、耐性が出来てしまったりする可能性もあります。高濃度のミノキシジルを購入して個人で扱うのは特に注意をします。
医師の指導の元、ちゃんとした使い方をすれば副作用の発生率は２〜３％ほどです。